Prediction of gait kinetics from joint angles using machine learning in patients with cerebral palsy
Künye
Özateş, Mustafa Erkam (2023). Prediction of gait kinetics from joint angles using machine learning in patients with cerebral palsy. Türk-Alman Üniversitesi, Fen Bilimler Enstitüsü, İstanbul.Özet
Joint moment and ground reaction force (GRF) during gait provide valuable
information for clinical decision-making in patients with cerebral palsy (CP). Joint moments
are calculated based on GRF using inverse dynamics models. Obtaining GRF from patients
with CP is challenging. Typically developed (TD) individuals' joint moments and GRFs
were predicted from joint angles using machine learning (ML), but no such study has been
conducted on patients with CP. Accordingly, we aimed to predict the vertical GRF, dorsi plantar flexion, knee flexion-extension, hip flexion-extension, and hip adduction-abduction
moments based on the trunk, pelvis, hip, knee, and ankle kinematics during gait in patients
with CP and TD individuals using one-dimensional convolutional neural networks. The
anonymized retrospective gait data of CP and TD subjects were used. The data were
collected in the course of patient care over the last two decades in the Department of
Orthopedics and Traumatology of Heidelberg University. For broadening the ML study, we
trained specific ML models of ridge regression, random forest, multilayer neural network,
k-nearest neighbour, long short term memory neural network algorithms by using manually
extracted time domain features and automatically generated features of gait kinematics.
Their performances were evaluated and compared using isolated test subject groups based
on normalized root mean square error (nRMSE) and Pearson correlation coefficient (PCC).
Joint moments were predicted with nRMSE between 18.02% and 13.58% for the CP and
between 12.55% and 8.58% for the TD groups, whereas with PCC between 0.90 and 0.96
for the CP and between 0.96 and 0.99 for the TD groups. GRF was predicted with an nRMSE
of 7.47% for TD subjects and 11.75% for CP subjects, while with a PCC score of 0.98 for
the TD and 0.94 for the CP group. ML algorithms using time domain features and
automatically generated features showed similar performance. ML-based joint moment
prediction from kinematics could replace conventional moment calculation in CP patients in
the future, but the current level of prediction errors restricts its use for clinical decision making today.
Keywords: Machine Learning; Cerebral palsy; Gait; Ground reaction force; Joint
momen Serebral palsili (SP) hastalarda yürüme sırasında eklem momentleri ve yer reaksiyon
kuvveti (YTK), klinik karar verme sürecinde değerli bilgiler sağlar. Eklem momentleri, ters
kinematik modeller kullanılarak YTK'ne dayalı olarak hesaplanır. SP'li hastalardan YTK
elde etmek zorlu bir süreçtir. Sağlıklı bireylerde eklem momentleri ve YTK'leri, makine
öğrenmesi (MÖ) kullanılarak eklem açılarından tahmin edilmiştir, ancak SP'li hastalar
üzerinde böyle bir çalışma henüz yapılmamıştır. Bu nedenle, bu çalışmada SP'li hastalarda
ve sağlıklı bireylerde yürüme sırasında gövde, pelvis, kalça, diz ve ayak bileği kinematiği
temel alınarak dikey YTK, dorsi-plantar fleksiyon, diz fleksiyon-ekstansiyon, kalça
fleksiyon-ekstansiyon ve kalça addüksiyon-abdüksiyon momentlerinin bir boyutlu
konvolüsyonel sinir ağları kullanılarak tahmin edilmesi amaçlandı. SP ve sağlıklı deneklerin
anonimleştirilmiş geriye dönük yürüme verileri kullanıldı. Veriler, Heidelberg Üniversitesi,
Ortopedi ve Travmatoloji Bölümü'nde son yirmi yıl içinde hastaların klinik çalışmaları
sırasında toplanmıştır. MÖ çalışmasını genişletmek için, yürüme kinematiğinin zaman alanı
özniteliklerinin manuel ve otomatik olarak çıkarılması yöntemleri kullanılarak ridge
regresyon, rastgele karar ormanı, çok katmanlı sinir ağı, k-en yakın komşu, uzun-kısa süreli
bellek sinir ağı algoritmalarının özelleştirilmiş MÖ modelleri eğitildi. Performansları,
normalize edilmiş karesel ortalama hata (nKOH) ve Pearson korelasyon katsayısı (PCC)
kullanılarak izole edilmiş test örneği gruplarında değerlendirildi ve karşılaştırıldı. Eklem
momentleri, SP grubu için %18,02 ila %13,58 arasında nKOH ve sağlıklılar grubu için
%12,55 ila %8,58 arasında nKOH ile tahmin edildi, SP grubu için 0,90 ila 0,96 arasında
PCC ve sağlıklılar grubu için 0,96 ila 0,99 arasında PCC ile tahmin edildi. YTK, sağlıklı
bireyler için %7,47 nKOH ve SP’li hastalar için %11,75 nKOH ile tahmin edildi, sağlıklılar
grubu için 0,98 PCC ve SP grubu için 0,94 PCC ile tahmin edildi. Makine öğrenimi
algoritmaları, manuel ve otomatik çıkarılmış öznitelikleri kullanarak benzer performans
sergiledi. Makine öğrenimine dayalı eklem momenti tahmini, SP’li hastalarda geleneksel
moment hesaplamanın yerine geçebilir, ancak mevcut düzeydeki tahmin hataları, klinik
karar vermede bugün kullanımını sınırlamaktadır.
Koleksiyonlar
- Tez Koleksiyonu [7]